美国的两艘驱逐舰和一艘护航驱逐舰也被击沉没,两艘驱逐舰受伤。美国总共损失了一百六十余架飞机,潜艇和护卫舰也有不同程度的损伤。盟军海军方面一共伤亡了约三千人。
日方在这场战役中损失比盟军更严重。所有的航空母舰全部沉没,三艘战列舰沉没,十一艘驱逐舰沉没,六艘重巡洋舰沉没,四艘轻巡洋舰沉没。还有六艘战列舰受重伤,其中一艘在返航途中沉没。重巡洋舰六艘也有不同程度的伤害,其中三艘因为受伤过重,不能恢复战斗力,两艘在一个月后也被击沉。另外飞机损失接近三百余架,伤亡超过一万人。
日军在这次战役中的损失达到自珍珠港事件以来日军损失的四分之一。这场战役让日本的海军几乎损失了全部力量。莱特湾海战规模庞大,战场宽达六百海里,所涉及的武器装备也是数量最多的。这一场战役不仅摧毁了日本的海上力量,连空军力量在之后的战役中也大打折扣。除了陆地上基地飞机外,日本再没有任何多余的力量。这就是莱特湾海战结果。