慕容令是后燕开国皇帝、成武帝慕容垂的嫡长子,母亲是成昭皇后段氏。成昭皇后是个性情刚烈、顽强的女子,她是慕容垂的结发妻子,段部鲜卑首领的女儿, 当时可足浑氏诬陷段氏使用巫蛊之术,被抓去严刑拷打,段氏怕连累丈夫性命,死也不肯屈打成招,最后被严刑拷打身亡,慕容垂失去爱妻悲痛万分,多年后他忍辱负重建立了后燕,废了可足浑氏的灵位,为发妻报仇雪恨。
段皇后留下了两个儿子,慕容令和慕容宝。慕容令的身上有其母的影子,性情刚烈勇敢、有勇有谋,当时被誉为慕容氏第四代中最杰出的人才,可比肩太原王慕容恪,评价十分高。
当时慕容垂抵挡桓温北伐有功,却受到猜忌,慕容令建议父亲投靠前秦,慕容父子俩果然受到苻坚的热情接待。第二年,慕容令跟随王猛讨伐前燕,因为种种关系,被放逐到辽西,后来他再想回到前燕的时,却被弟弟慕容麟告密,最后死在了部下手里,实在可惜。
慕容垂建立后燕之后,追封慕容令为献庄太子。慕容垂虽为开国皇帝,子嗣众多,可却选择了最无用的儿子继承皇位,也就是慕容令的亲弟弟慕容宝,此人昏庸无能,后燕没过多久就灭亡了。