受了伤的但懋辛在厕所等了一天又一天，幸好群众同情革命党人，清洁工主动给他送来食物。在群众的帮助下，他躲了几天。抓捕革命党人的风声过去后，他戴上斗笠做了一番改装，冒雨到东一区找李天均。不料在警察所的门口，但懋辛的斗笠被疑心的警察掀开，革命党人的短发被发现，他被捕了。

巡警道台王秉恩是四川成都人，圆滑世故，老于官场。由于但懋辛的案子牵涉到他的部署李天均和皱有章，他怕负有用人不当之责而连带丢官。于是为了敷衍上司，故意上报说但懋辛是自首，为他开脱。把他交回原籍，严加看管。

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四、讨袁兵败

几个月后，武昌起义一声枪响，清王朝就土崩瓦解了。当但懋辛从广东被押回四川时，重庆已经独立，他因此获得了自由。

可是同盟会的同志们却以为他真的自首了，瞧不起他，让他在新政府的招待所里当一名招待。同盟会的机关报《民立报》还发表文章骂他。付出了鲜血，经历了生死劫难，但懋辛面对的却是自己同志的误解和蔑视。

他并不怨天尤人，他以非凡的气度，认真周到地接待外省来川的同志。政权初建，政务需要人，与清军作战也需要人。在讨论参谋长人选时，有人提出应让但懋辛来担任。谢持说：“早就想过，可是他（但懋辛）在黄花岗之役贪生怕死，丧失了革命党人应有的气节。”

新任财政部部长的李湛阳听后，立即站起来说：“我很奇怪为什么你们不用但懋辛，原来如此！当广州起义时，我在督练公所任职。但懋辛的供词经制台张鸣岐批令不杀后，我问巡警道王秉恩原因。王说，他见但懋辛写的自供状，措辞巧妙，避重就轻大为诧异。短短时间就写七八百字，叙事清楚。因而大加赞赏，加他一个自首，为他开脱。并告李军门善为转说制台，此人不要杀。隔两天，张鸣岐电话告诉王秉恩说，但被押到后，在几位会审官面前毫无惧色，态度坦然。我后来又特地同他详谈，发现他有胆有识。”

一番话解除了大家的误会，但懋辛被推选为蜀军政府参谋长。 1912年4月，成渝两地军政府合并，以成都为四川政治中枢，设都督府。尹昌衡为都督、张培爵为副都督，但懋辛为成都府知府兼四川团务督办。

但懋辛到任后，在府内设置单杠、木马、吊环等体育设施，公务之余，在器械上翻飞腾跃，前仰后俯，潇洒自如，犹以翻“大车轮”为甚，观众眼花缭乱，私下议论，历来知府，无不管带整齐，谈吐风雅，启如但知府，虎虎生风如顽童耶。

在帝国主义的支持下，袁世凯依仗自己掌握的军队就任大总统后，他开始对革命党人进行残酷的迫害和屠杀，解除了江西、安徽、广东三省的国民党都督、李烈钧、柏文蔚、胡汉民的职务，7月四川都督尹昌衡出兵川边，袁世凯乘机委派自己的亲信胡景伊代理总督。四川的革命党人对此强烈不满，但懋辛为此辞去成都知府职务，到重庆任熊克武第5师参谋长。

孙中山号召各省革命党人武装反袁。熊克武召集同盟会负责人和第5师团级以上长官开联席会议，决定通电全国宣布独立。会上大家一致选举熊克武为四川讨袁总司令，杨遮堪为民政厅长，刘植藩为总参谋长，但懋辛为副总参谋长。

8月4日，熊克武正式就职，发表了《誓师文》和《告四川军界同胞文》。四川讨袁的战斗节节胜利，可黄兴、李烈钧讨袁失败的坏消息却不断传来。由于川督胡景伊向袁世凯急电求救。袁世凯派滇、黔、陕、甘、鄂五省军队会剿熊克武的四川讨袁军。重庆大本营被敌人重重围困，为使重庆百姓免遭战火，熊克武的讨袁军退出重庆，第5师解散。

此时，四川的革命党人对熊克武有意见。海外革命党人不同意孙中山组织中华革命党“服从总理一人”的效忠宣誓。革命党人四分五裂，人心涣散。

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五、护国复出

1915年袁世凯下令取消国会，废除临时约法，准备恢复帝制。

12月12日，蔡锷摆脱袁世凯的监视，潜回云南。但懋辛也到了云南，参加了由唐继尧和蔡锷主持的起兵讨袁军官联席会议。23日，但懋辛、熊克武等人随护国军第一支队邓泰中部出发。部队向叙府挺进时，一些地方团队和旧部纷纷前来请熊克武收编。川军再次组建起来，熊克武成为护国军四川招讨军总司令，但懋辛依旧担任参谋长。

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六、叛孙自立

护国战争虽然成功，但民国内乱不已，四川内乱不已。段祺瑞废弃临时约法、解散国会。而四川境内的各党、各派、滇系、黔系、川系军阀争斗不止。孙中山在广州召开非常国会，开展护法运动。9月10日，孙中山就任大元帅。熊克武在但懋辛的支持下响应护法。

1918年1月9日，熊克武就任唐继尧委任的四川靖国各军总司令，在重庆与滇、黔军联合召开军事会议，讨伐北京政府任命的四川督军刘存厚。会议决定分三路进攻成都，出师平定川西。东路由滇军顾品珍、赵又新两部负责；中路由黔军袁祖铭、王天培两部负责，北路由但懋辛率吕超、喻培棣从川北直逼成都。

刘存厚率部仓皇出逃。2月24日，熊克武电令但懋辛代理省长。3月8日孙中山大元帅命熊克武为四川督军。4月7日，但懋辛任四川靖国军第一军司令。他命令吕超、喻培棣继续追击刘存厚，一直把穷寇赶到陕西汉中。

由于熊克武在整编川军的过程中，对支持孙中山一系的石青阳、黄复生、颜德基等民军的限制，对孙中山任命的省长杨庶堪也处处限制，1919年夏，孙中山以大元帅的命令下令联合滇黔军打倒熊克武。

当时熊克武第一军的三个师中，第五师吕超决议倒熊，第三师向传义首鼠两端，第一师但懋辛师也只能控制两个团，只好以退为进，宣布下野，但懋辛和吕超虚与委蛇，假意推吕超为川军总司令，等到熊克武一切准备就绪，就在但懋辛支持下复职，立即遭到唐继尧下令讨伐，黔军参谋长朱绍良公开宣称。

川军的事如果川军不能自己解决，滇黔军决不能坐视不理。但懋辛部立即向驻简阳的滇军发生进攻，由于与顾品珍有了默契，顾品珍稍打即退，先后让出了简阳。资中、资阳、内江，把部队撤到川边的泸州，准备回师讨唐，

然而由于唐继尧善于运用分化瓦解之术，南路刘成勋追击到自流井后不战退回新津，东路刘湘被黔军赶出重庆，北路吕超看到熊克武各部失利，立即宣布加入倒熊阵营。但懋辛部孤军突出，军心涣散，作战接连失利。

1920年，唐继尧联合四川国民党人黄复生、卢师谛、吕超等人发起了对熊克武的进攻。8月，熊克武发动了驱滇黔之战：任命刘湘为前敌总指挥，兵分两路，但懋辛率一路由绵阳、罗江、广汉攻成都；第二路由三台经中江、金堂与一军会合。

9月8日至21日，两军在龙泉驿交战十几日，滇军大败，赵又新在泸州阵亡，顾品珍不听唐继尧的调遣径自回云南。9月19日，刘湘攻下成都，10月15日，但懋辛再次占领重庆。熊克武10月30日到重庆后与但懋辛、刘湘、赖心辉等人商量四川善后办法。

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七、内战败落

1920年，全国各省主张自治和废除督军的呼声很高。在北京有15个省区的人分别组成了“自治运动会”，还推举代表成立了15省的“各省自治联合会”。

在但懋辛的支持下，12月30日，熊克武正式通电解除督军职务，宣布四川自治。但懋辛、刘湘分别代表1、2军通电表示支持。但还草拟了“告全军将士书”：“为今之计，只有两途，不愿自治，便降曹吴，二者择一，为主为奴，严颜有言，降将蜀无，共体斯意，其各勉乎！”

然而，北洋政府就在这时任命刘存厚为四川督军，熊克武为省长，刘湘为重庆镇守使。主张自治的熊克武立即通电拒绝任职，但懋辛支持熊的决定，与第2军刘湘、第3军军长刘成勋一起发出通电，响应熊克武的决定，拒不接受北洋政府的任命。

2月18日，熊克武、但懋辛、刘湘联衔通电，宣布刘存厚的罪状，然后，兵分三路讨伐刘存厚。刘军节节败退，3月中旬退至陕西宁羌。从此，接受北洋政府任命的刘存厚做了“流亡督军”。战争结束后，熊克武通电隐退，刘湘任四川总司令兼省长。

刘湘主政四川后，为缓和两军矛盾，约定一起援鄂，但被吴佩孚打败，刘湘再命第一军的张冲混成旅援陕，遭到但懋辛拒绝。1922年刘湘邀但懋辛到重庆，提出军事复原，要1、2军裁员。但懋辛与刘湘达成了协议：第1军裁编杨春芳旅，第2军裁汤子模旅。

然而，就在但懋辛裁兵之际接到了密报：刘湘的目的是借改编为名，诱第1师到忠县，全部消灭一军。风云突变，但懋辛将情况电告熊克武，熊回电要但命令各部队，“迅速做好战斗准备，但要沉静以待，按兵不动，让刘湘开第一枪，以争取主动，必要时，可以通电，揭露刘的阴谋。”

但懋辛将刘湘的阴谋向各友军揭露，并质问刘湘。一时间，川中各军对刘湘大为不满。刘只得通电辞职。

10月26日，在成都召开善后会议解决四川军政民政两大问题。当时有人建议，但懋辛任川军总司令，刘成勋为省长。但是，赖心辉却对熊克武说，刘成勋在川军中深孚众望，为统一川政，拟刘成勋任总司令，一身兼军民两政。

经熊克武建议，会议决议：一、四川采取联省自治态度，促成国宪之合作统一；二、推刘成勋为川军总司令，在省宪法未制之前，权摄民、政；三、废除军长制，分期裁兵；四、破除防区，统一财政。

然而废除军长制又触犯了一些人的利益，邓锡侯、陈国栋对此不满，引起川军再次内讧。1923年2月邓锡侯、陈国栋与第一军在江津、永川、铜梁、大足荣县、内江、资中展开了拉锯战。吴佩孚支持的杨森部乘机占领重庆。

在四面受敌之时，但懋辛建议熊克武到广州求的孙中山的谅解，重新获得政治上的名义。不久，吕超、石青阳回川帮助熊克武，6月4日，孙中山任熊克武为四川讨贼军总司令，赖心辉为前敌总指挥。

滇军胡若愚12个团重新入川帮助熊克武。但懋辛率1、6两师及2、8混成旅，在上川东与吴佩孚策动的刘湘、杨森、潘文华、唐式遵及贵州军阀袁祖铭等北洋军苦战20多天。占领了重庆后，但由于担心赖心辉功高难制，由但懋辛接替赖心辉担任前敌总指挥，临阵换帅，导致各军不能齐心合力，重庆得而复失，军队一度瓦解。

八、连陈招祸

四川讨贼之战失败后，但懋辛受熊克武派遣，偕湖北讨贼总司令孔庚、石青阳到贵阳与刘显世协商，达成三省合作的议向。然后征得云南唐继尧同意，但懋辛拟好“建国联军协议”草案。

三省代表签字后，协议正式生效。唐继尧为总司令，刘显之为副司令，熊克武为前敌各军总司令兼建国联军川军总司令，驻军湖南常德。

一切商妥后，但懋辛与石青阳、孔庚三人携协议前往广东向孙中山汇报。孙中山对他们的作为非常赞赏，特地在元帅府设宴欢迎他。孙中山重视但懋辛的人格和才干，任命他为大元帅府大本营政治顾问兼国民参政员。

为了北伐顺利进行，还特地委派但懋辛到东江去说服陈炯明、林虎与广东革命政府保持一致。辛亥革命时期，但懋辛与陈炯明一起筹办广州起义建立了很好的友谊。孙中山对但懋辛说：“只要陈炯明写一个悔过书，（对陈反对他的事）就不加追究。”

但懋辛到东江后，对陈炯明晓之以理、动之以情做了许多工作，可陈炯明推说，要林虎和洪兆麟同意才能答复。但懋辛不拒繁难，又去会林虎。林虎表示，决不乘孙中山北伐之机打广东。但懋辛终于圆满完成了任务，回韶关向孙中山做了汇报。

11月2日，孙中山应冯玉祥、段祺瑞的邀请北上，“共筹统一建国之方略”，但懋辛随同前往。到北京后，孙中山本主张召开国民会议，可是因过于操劳一病不起，不得已他派汪精卫同张作霖、段祺瑞商量同意召开善后会议。

但懋辛作为建国军四川代表参加了善后会议。南方代表提出，应邀职业团体参加，段祺瑞坚决反对。为揭露段祺瑞所把持会议，欺骗舆论的阴谋，但懋辛根据孙中山指示的退出善后会议。

胡景翼是熊克武、但懋辛的老朋友，得知熊克武准备出师北伐攻取武汉，十分赞同。在胡的邀请下，但懋辛从北京赶到河南开封，双方进行了深入的研究探讨。决定，两军加强团结，全力整训部队，等待时机，安定大局。

为了团结更多的人一同北伐，但懋辛受胡景翼的委托与张冲到洛阳联络阚玉昆。在但懋辛的介绍下胡景翼与阚玉昆结拜为把兄弟。

湖南军阀赵恒惕对熊克武的驻军在湘十分嫉恨，因胡景翼警告赵恒惕不得阻挠西南联军北伐，才不敢妄为。为消除误会，1925年2月熊克武邀赵恒惕面谈，然而不欢而散。3月12日孙中山在北京逝世。

20日但懋辛赴河南又遇胡景翼暴病身亡，北伐的计划落空。为避免冲突，6月熊克武率部到广东驻防连山、连南、阳山一带。汪精卫、谭延闿、蒋介石为夺熊克武的几万部队，捏造熊派但懋辛与陈炯明勾结的罪名，于8月16日把熊克武扣押在虎门，并下令通缉但懋辛。四川建国联军被瓦解了。

但懋辛在北京得知此事痛心疾首，立即写信给汪精卫，对强加给熊克武的种种罪行一一做了澄清，最后他悲愤地写道：“国难方殷，同志凋残，追念前尘，惟有悲痛。”然而信如泥牛入海没有消息。他又辗转上海、香港，联络各方人士营救熊克武。

可是，直到1927年熊克武的妻子发现孙中山去北京前用英文写给熊的亲笔信，托张群交到南京政府，蒋介石才不得不放人。但懋辛在香港车站迎接熊克武，两人见面百感交集。

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但懋辛的结局如何

1929年，但懋辛和熊克武在上海再次办起了中国公学。他们要培育青年，主要是川籍家境贫寒的学生。1931年，蒋介石又拘押了胡汉民。但懋辛、熊克武积极营救胡汉民，但是没有成功。

1937年抗日战争爆发后，杨森率二十军参加淞沪抗战，但懋辛、熊克武亲赴战地慰问将士。沪战失败后，但懋辛转到南京，被任命为军事参议院上将参议。他积极动员和团结四川各方面的力量支持抗战。

1946年7月31日国民革命政府授任周濂、李济深、但懋辛、李杜、张钫、石敬亭、郭汝栋、金汉鼎等八人为国民革命军上将（均为非现役将领，并予退为备役）。

1947年他被选为任四川第二行政区国大代表，1948年当选为立法委员。他反对蒋介石的独裁统治，积极开展民主活动。他参加金绍先等人在立法院组织的以反对独裁为目的的“二·五座谈会”，共商国是。

在北平和谈期间，座谈会由他领衔发表了《拥护和谈的宣言》。成都解放前夕，他运用自己在四川的声望和影响，协助共产党地下组织在国民党军政界联络策反，使刘文辉、邓锡侯、潘文华、鲁崇义等人起义，对成都的解放做出了贡献。

1949年10月18日政务院第六次会议提议，12月2日，中央人民政府第四次会议批准，但懋辛任西南军政委员会委员兼司法部部长。1950年1月，贺龙将军受毛主席、朱德总司令的委托，亲自看望但懋辛，请他对四川的工作提意见。

1950年7月，但懋辛到北京开会，由李济深、朱蕴山介绍，加入了中国国民党革命委员会，任中央委员。民革川康临时工会成立，但懋辛任副主任委员。

民革烈士、前同济大学校长周均时于全国解放前夕被国民党特务在重庆歌乐山渣滓洞杀害。牺牲前他在监狱托人带话给但懋辛，请但代他照顾自己的家属和子女。

新中国成立前，周均时的妻子去了香港，儿子留在大陆。但懋辛不负老友的嘱托，设法保荐周均时的儿子进了清华读书，毕业后在国防部门工作。老同盟会员席正铭的女婿因历史问题被判入狱，全家5口人生活陷入绝境，求助于但懋辛，但收留了他们，帮助他们工作和就学。

柳亚子曾经有诗赠但懋辛，说他“四十五年身是史，西蜀全才但怒刚”。但懋辛通易理、诗词，尤其擅长书法。

他幼时学唐楷，特别致力于颜体，后来受康有为倡导的求变崇碑思想影响，开始追寻魏晋、秦汉、商，对汉隶和魏碑特别用功，喜欢研读碑帖。认为碑与帖各具美学特色，碑重雄强古朴，帖尚妍润隽雅。他的字深厚功底、技艺高超，兼容各家之长，他的字饱含着他的学识、修养的胸怀，形成自己的风格。

无论是戎马倥偬之时，还是政务繁忙之际，他读书、写字的爱好从没有放下。因此，他的书法墨迹在近代中国书坛颇负盛名，北京的香山孙中山衣冠冢、成都的都江堰、望丛祠等，在全国许多名胜古迹都有他的书法碑刻。

1954年中央撤销西南大区，但懋辛到成都任职。先后担任当选为第一、二、三届全国人大代表、省人民代表和省政协第一、二、三届副主席。中国国民党革命委员会中央委员会委员、常委，民革四川省委会主委。

1965年11月7日，但懋辛因心力衰竭在四川省人民医院逝世，享年79岁。在追悼会上但懋辛的老朋友熊克武赠挽联：

六十年革命相期，少同学、长同盟、壮同军旅，追念平生风义，契兼师友，竟重泉永隔，痛何可言；七千里停云在望，坐能言，起能行，老能前进，亲见祖国光辉，照遍寰瀛，即黄土长埋，死犹含笑。