然而，好景不长，由于赫氏意外身亡，亚氏失去庇护，不得不携带妻小家眷逃离密细亚，一段时间的颠沛流离之后，辗转到了米提利尼。

三年后，亚氏收到来自故国的召唤。马其顿国王聘请他为年幼的儿子授课。根据相关传记的描述，亚氏对这个幼童进行了精心的培育，不但教授其有关技术的知识，更重要的是向其灌输了关于道德方面的信念。事实也确实表明，成年后的王子在很多方面都表现出类似亚氏的行为。比如他终其一生都对知识和知识分子表现的非常尊重。

虽然学生做了国王，自己已经贵为帝师，但是亚氏并没有栈恋权位与富贵，而是回到文明之都雅典，建立一个新的学习之地，在那里教学。并藉此建立起亚里士多德学派，这是亚里士多德的成就之一。