朱慈焕与六子、七子早年夭折外。长子朱慈烺这位皇太子，于大顺军攻破北京时被俘，封为宋王，李自成逃离北京时已16岁，不知所终。三子定王朱慈炯，崇祯十七年北京沦陷时14岁，下落不明。四子永王朱慈炤，北京失陷时也下落不明。六个女儿中，有四个早年夭折；长平公主被崇祯砍掉右臂，侥幸不死，顺治三年（公元1646年）病逝，早些年香港拍的电视剧《帝女花》讲述的便是这位长公主的故事。幼女昭仁公主，明亡时也被父亲一同殉国。