两年以后，也就是1963年，肯尼迪总统遇刺，五年以后，肯尼迪的兄弟也被杀。很多人认为肯尼迪兄弟的死跟猪湾事件有关。因为根据证据显示，猪湾事件的参与者默拉莱斯、乔尼得斯在肯尼迪遇刺前曾出现在现场，他们是肯尼迪的憎恨者。因此，有人推测，是他们杀死了肯尼迪。

不过，由于肯尼迪的死太过扑朔迷离，这个推测也仅仅只是众说纷纭里面的一种说法。但是对于“美国肯尼迪被刺杀与猪湾事件有关系吗”这个问题，依然有不少的历史爱好者在孜孜不倦地研究着。