一个是仙女瑶姬的传说，瑶姬是天庭中西王母娘娘最宠爱的女儿，她因为看不下去人间如此的困苦，于是就私自下凡帮助老百姓，制服了当时的十二头恶龙，最后十二头恶龙化为了十二座大山抵挡住了人们的去路，于是瑶姬将其之间开了一条河流，最后瑶姬以自身幻化成万物来使人们的生活变得更好，瑶姬变成了一块巨石矗立在了巫山之顶。

还有一个就是战国时期楚王来到此地游玩，晚上做梦梦见自己与仙女幽会，而此后，就被人们传言巫山有神女之说。

唐朝和清朝的时候神女庙都有过重修，但是在期间也发生了很多令人可惜的事情，唐朝一次重修，却被一个流浪汉一不小心给烧了，再后来就是当初我们国家备受外国人的侵略而使得神女庙毁灭，这实在是可惜。

巫山神女庙也是一首诗，其作者为著名诗人刘禹锡，其诗中讲的就是楚王与仙女幽会的事情，不过在这一首诗中，描述了巫山的美轮美奂，作者对巫山的无限感叹之情，同时也带着了一点讽刺的味道。