许多人类学家都认为，尼安德特人的消失是现代人祖先所导致的，但亚利桑那州立大学的C。 Michael Barton教授则认为：尼安德特人实际上并没有消失，而是在晚更新世时期因文化和气候的压力导致尼安德特人和现代人祖先聚集到一起，尼安德特人基因也被融合到了现代人类基因库中。

研究人员通过考古资料追踪了在过去12万年时间里欧亚大陆西部古人类文化和社会形态学的变化。在末次冰期里，尼安德特人和现代人祖先的土地利用模式都发生的转变，他们之间已经开始了相互交流和交配。在此期间他们不仅在基因上进行了交流，文化上也相互受到影响，并且因为尼安德特人的活动区域仅限在欧亚大陆的西部，作为种群数量较少的一支而惨遭灭绝。然而，部分杂交群体所携带的尼安德特人基因并未消失并得以保存下来。

Riel-Salvatore也说到：“最近古尼安德特人的DNA序列研究显示了，我们现代人类的基因有1～4%是来源于尼安德特人的，特别是欧洲人后裔尤为显着。虽然尼安德特人作为一种独立的人种已经消失，但他们仍“存活”于我们的基因中。”