陕西人口在战乱中损失达622万，甘肃（此时的甘肃省包括今甘肃省以及宁夏回族自治区、青海省东部大部分地区）人口损失达1355.5万，陕甘合计约2000万，其中汉族损失人口约1500万，回民损失人口约400万。

　　陕甘回民起义的真相

　　1862年，因为买猪事件，在陕西渭南爆发了回回叛乱，很快波及西北五省区。这次叛乱导致的直接的后果是种族屠杀，其残忍程度决不亚于非洲卢旺达、乌干达的胡图与图西人仇杀。表面看是一场叛乱，其实是积压了多年的汉回矛盾的总爆发，而不是人们理解的什么人挑拨，叛乱的爆发只是迟早的事情。在这次叛乱中，陕西原本人口有1300万，回回大约400万，战后统计的陕西人口约700万，回回人口为5万。战乱中有大约有350万回回被杀，45万人逃亡；汉人被杀者有100余万。叛乱后的陕西，回回人数下降了93%，陕西成为中国民族成分最为单一的省份，关中农村几乎难觅回回的踪迹。但这次叛乱给后世的陕西和西北留下了永久的伤痛。

　　陕西兴平，曾经是回回叛乱的重灾区，兴平北部有一道塬，当地人习惯称之为北莽山，这个塬上就是当年汉回大仇杀的主战场，也留下了大量有关回回叛乱的传说和故事。据老人们讲，当年北塬上住着许多回回，平日里和汉族有不少矛盾，同住一个村子，回回很霸道，不许汉族在他们所谓的井里打水，两族的孩子在一起玩耍回回孩子回家要漱口。同样汉族也很讨厌回回家里的羊膻气味，讨厌回回的礼仪有失风化，互不婚嫁。在叛乱期间，白日里看似平静，到了晚上回回就开始聚众围困汉族村庄，一般是整村灭绝，除了陕西回回，还有来自甘肃的回回，宿居当地回回家中，晚上集体行动。就这样北塬上的村庄几乎被回回屠杀殆尽，以致于100多年后的今天，北部塬上的人口密度也远远低于南部地区。

　　在陕西户县，听说有这样的一个故事，依然是发生在回回叛乱期间，牛东乡有个村子叫马家村，1867年冬天，回回围困了该村，从西往东开始埃家杀，杀完人开始放火烧房子，等杀了村子中间，一看有一家店铺，上面写着“马家当铺”，他们以为是错杀了同族兄弟，这才放过了村东人家离去，使得该村半数人家侥幸逃生。当年户县东部临近沣河岸边的地区和长安、兴平、泾阳、三原、渭南等地一样，是汉回大仇杀的重灾区，汉族的人口损失近半，这个回回聚集区在叛乱后已经完全失去了回回踪迹。

　　陕西周至，是关中民风最为强悍的一个县，回回叛乱期间，该县各村结寨自保，但是回回在这里也是最为残忍的杀人，汉族也是最为残酷的复仇。有个村子叫萧家村，回回围困该村后全村奋起抵抗，最后回回采用了种族灭绝的方式，一把火将该村男女老少全部烧死，大火两日不灭。还有个叫“五屯”的村庄，主要是回民，在左宗棠的汉军抵达陕西后，人们尊称左爷来了，左爷的大军对五屯同样进行了种族灭绝，这个村庄彻底从地球上被抹掉了。据当地的老人说，左爷来了以后，汉民纷纷相助，带领汉军四处搜查回回，周至所有的回回村庄荡然无存，活着的回回都逃到新疆去了。直至新中国成立后，该县也没有一个回回村庄，个别村庄的散居的外来回人很难立足，不得已多数已放弃宗教改为汉族。

　　回民起义从没有进攻北京打击清政府的意图，说回民起义是反清，没有事实依据。而所有的事实都是,不断杀汉人村庄，攻击县城。一年时间关中２６个县长被回民杀害。所谓的回民起义实际上主要是为了杀汉人，

　　回民起义之初，主要是回汉民之间的矛盾，经常有械斗。当时７０％的汉民抽大烟，身体不好，而回民常习武，心齐，凶狠，械头时多数是汉民吃亏。回民起义起初的原因是，回民借满清军队集中到南方对付太平天国和云南回民起义，关中地区防务空虚，一些回民首领屠杀汉民报私仇。

　　当时的陕西巡抚面对防务空虚，提出的政策是安抚回民，派朝庭大臣陕西团练头目张芾前去安抚，想不到回民起义的发起人任武杀了张芾。为了鼓动回民，任武再杀了自己的老母、妻子和孩子全家，以表示自己已没有任何顾及，血战到底。

　　为了给回民起义找到正当的理由，一些历史研究者不断提说，当时有一个“秦不留回”的传帖，因而回民才要起义。对此，现在有案可查的是，当时陕西巡抚的初衷是要安抚回民，并不是“秦不留回”。一个事实是，满清政府对当时住在城里的回民未杀一人，现在的西安西大街回民坊还住着大量的回民。当时满清政府把城门紧闭，以防城外回民进城杀人，也阻城内回民出城杀人。

　　对于“秦不留回”的传贴，当时也许有，但满清政府没有这样的政策，有可能是有人有意挑拨回汉民族关系。更有可能是，这是一个编造的说法，以鼓动回民对汉人仇杀。

　　满清政府在对待民族关系上，回民列在汉民之前，所谓“满、蒙、回、汉”，汉民是最受歧视的民族。在满清期间，中国的人口大量增加，这说明满清的经济并不是民不聊生，而且发展很快。另外，回民多做小买卖、不抽大烟，在当时的关中农村，回民比汉民富裕。说回民起义是因受清政府压迫或是汉民压迫，是有意识找出来的理由。更不能以此为大屠杀辩解。