李贽一生著书良多，主要包括《藏书》、《续藏书》、《焚书》等，此外他十分推崇《水浒传》和《西厢记》并都做过自己的评点。在他的著作和讲学中，他时常针砭时事，评述历史。他反对反对儒家学说尤其是程朱理学，批判封建礼教对人的压迫；揭露并批判封建统治的黑暗本质，痛斥政治腐败；提倡功利，重视商人的地位；主张“童心说”，认为文章不能弄虚作假而要表达个人真实的内心。

李贽死后，后世对其褒贬不一，但他的著作虽然屡遭官府禁止，却更加广为流传。