原本还对南逃的兄弟们抱有希望，期望他们团结明朝势力重返京城收复河山。但是太子朱慈烺因为落魄不堪，自己又北上回到了他外祖父周奎的府前。公主是惊讶又欢喜，抱着弟弟痛哭良久。但是已经投靠清廷的周奎就此事告知了朝廷，于是多尔衮联合他假称朱慈烺是假太子。长平公主不干，却被外祖父打怕了，只能眼睁睁看着弟弟被斩杀，这令她心如绞痛。

不久南京的弘光朝廷也被拿下，皇亲王公们一个个都被擒杀。虽然清廷将长平公主和周世显的婚事完成了，但这已经不足以平息她心中的苦楚。国破家亡的痛苦，人心离散的现实，令长平公主生无可恋，终在抑郁中于顺治三年离世。