10月6日，经过国会选举，任袁世凯为第一任大总统。同年，袁世凯政府制订了一系列法律，《国会组织法》、《公务员奖惩条例》和《文官考试法》，由此建立了中国近代司法制度。袁世凯拒绝承认英国企图分裂西藏的麦克马洪线，维护西藏领土主权。

1914年，袁世凯下令解散国会，废止中华民国临时约法，并且正式推出《袁氏记法》，改内阁制为总统制，完全推翻了革命党人建立起的共和政体，暴露其独裁野心。引起了各界的讨伐势力，革命党人前赴后继的组织革命运动，誓与袁世凯对抗到底。

1916年3月22日，袁世凯被迫取消帝制，恢复中华民国年号。6月对外宣称因尿毒症不知身亡。