朝中大臣告诉秦惠文王，商鞅因位高权重，想要谋反。秦惠文王意识到商鞅的存在已经危害到他的统治权，加上商鞅以重刑处罚了他的老师，秦惠文王以此为契机，下令抓捕商鞅。商鞅得知后，逃到了边关。夜已经很深了，商鞅打算找一家客栈住宿，商鞅从家中匆匆逃出，没有带相关凭证，客栈的主人不敢收留他，并且声称，如果不遵守，就会实行商君的连坐惩罚。商鞅一面感慨法律的深入人心，另一方面又觉得无可奈何。

商鞅逃到了魏国，但是魏国没有接纳他，商鞅不得已逃回他的封地，组织手下的士兵攻击郑国。秦惠文王知道后，下令讨伐商鞅，商鞅兵败后将他在黾池杀死，商鞅的尸体被带回秦国。秦惠文王下令将商鞅尸体进行车裂，商鞅的家人和朋友也难于幸免，都被诛杀。