终于有一天，李世民忍无可忍，决定先下手为强，在魏征、长孙无忌等人的策划下，埋伏在玄武门下，将正要去上朝路过的太子李建成、齐王李元吉连同他们的部下，一起杀死了，并且把他们的妻妾儿子也全部杀死，李元吉这一支的后人几乎无一幸免，从此李元吉退出了历史舞台。