五年后，因契丹作乱，狄仁杰得以被重新启用，成为魏州刺史和幽州都督，都督乃是从三品的官职。

697年，狄仁杰再次被武则天拜为从三品的宰相。700年，狄仁杰升任为正三品的内史。可惜的是，狄仁杰也于同年去世，武则天痛心万分。