有人说，秦可卿是自杀身亡，为何会有这一说法呢？原因在于，秦可卿和公公贾珍的不伦恋情被婆婆尤氏发现了，秦可卿觉得自己没有脸面在留在世上了，便自缢身亡。

大多人较为认同秦可卿死因是因病而死。秦可卿应该得了一种慢性病，当她身体不舒服告诉尤氏时，尤氏找来大夫把脉，认定秦可卿并没有怀孕。但是，秦可卿已经有两个多月没来月经，这让尤氏十分担心。不久后，贾珍请来了宫中御医为秦可卿诊治，几位御医共同为秦可卿诊治，但是都没得出秦可卿得了什么病，该喝什么药。《红楼梦》中写到：“机关算尽太聪明，反误了卿卿性命”，虽然这句话是写给王熙凤的，用在秦可卿身上也不为过。秦可卿趁贾蓉不在家时，和贾珍发生了不伦之恋。秦可卿深知自己做法错误，但是只能越陷越深。也有一说是，焦大大骂秦可卿爬灰和养小叔子，这一事件刺激了秦可卿。所以，秦可卿最终死于心病和妇科病。