《四库全书》完成后，乾隆皇帝又命人抄写了7部，将《四库全书》分别藏于全国各大藏书阁。七部《四库全书》收藏的方位不同，位于北边的被称为“北四阁”，分别藏于紫禁城文渊阁、辽宁沈阳文溯阁、圆明园文源阁、河北承德文津阁。后抄好的三部《四库全书》被称为“南三阁”，分别藏于扬州文汇阁、镇江文宗阁和杭州文澜阁。

有人说乾隆皇帝主持的编纂《四库全书》一事对传播中国文化产生了积极影响，但是也有人说，乾隆皇帝借编书为幌子，大兴文字狱抑制先进的思想潮流。