在盘古开天辟地后，鲲鹏跟随东皇太一入主了洪荒天庭。被封为了亿万妖族之师，号鲲鹏祖师，又称妖师。一日，鲲鹏前往火云宫欲杀红云祖师。红云祖师不解，鲲鹏祖师当面质问其为何将道位让予准提，害他受此劫难。红云不好辩解，只能先行抵挡。

鲲鹏祖师乃妖族妖师，法力自然在红云之上。但是先前被准提等人所伤，一时难分高下。过了许久，鲲鹏祖师渐渐占了上风，红云渐渐不敌，于是舍弃肉身逃跑。但鲲鹏祖师仍紧追不舍，损好几个元会的法力去击杀红云祖师元神，红云祖师虽受东皇太一等人相助，但元神依然受了重创，不得不转世投胎重修。

而鲲鹏祖师最后在巫妖大战中逃跑，隐居在天界极北之地，银河源头北冥汪洋之中潜修。