历史上与他相关的故事非常的多，其中“秦琼观阵”非常出名。人们为了记住他的勇敢和智慧，将这一故事编为歌剧，相声以及歌曲等，广为传颂。“秦琼观阵”讲述的是秦琼年轻时，在任职捕快期间，和敌军首领杨林不期而遇之后发生的一系列故事。杨林心肠歹毒，做事狠辣，他知道秦琼单枪匹马在自己的势力范围之后，下令将他活捉，百般刁难并设下许多狠厉的阵法。他扬言说，这一系列难阵如果秦琼破得，自然能成功身退，他自会放秦琼回去；只是如果破不得，他定要秦琼身葬沙场。杨林摆的阵非常狠厉，十分难破，更何况秦琼一人单枪匹马更是难上加难。但秦琼毫不在意，并且视死如归，他毫不迟疑的闯入阵中，这份勇敢和果敢让人惊叹不已。秦琼闯入阵中后，幸而得到了瓦岗中众多英雄豪杰的帮助，成功回营。“秦琼观阵”这个故事也传颂开来了。

秦琼的勇气果敢为天下人所称道，但是这并不过分，倘若没有他出的一份力，李唐阵营怎会那么快的获得胜利呢？