现在看来，他们为中国创造了最灿烂的思想文明，使中国得以与同时期的希腊文明媲美。但是对于统一六国后的秦始皇而言，百家相争是混乱，是隐患。虽然秦始皇为什么要焚书坑儒，因为他要消除隐患，加强专制的思想统治。

焚书在前，坑儒在后，焚的是除医药、卜筮、农业有关之外的所有书，坑的其实也不是表面上的儒士，而是方士。焚书是因为秦始皇是一个改革者，统一中国、废分封设郡县、中央集权等等措施都是他首创，而那些书尤其是儒家书籍最大的特点就是师古，就是崇尚上古或者西周，此外大多和法家相悖，这样的思想对于运用法家思想的秦朝而言是危险的。而坑儒是因为，这些方士欺骗他可以寻仙访药让他长生不老，而秦始皇花了大量人力物力后一无所得所以恼羞成怒，而可能是因为当时的方士也学儒家或者穿儒士的服装所以被认为是儒士。

毛泽东对此的评价是“劝君少骂秦始皇，焚坑事业要商量”，可见他赞成秦始皇。