而北洋政府和军阀内部也在出现了问题，黎元洪公开反对袁世凯的行为，并辞去了自己的职务，拒受册封。另一方面，段祺瑞、冯国璋和北洋元老徐世昌均对反对帝制的运动作消极抵制。紧随其后，四川和湖南等地也宣布独立。这时，一些原本支持称帝的帝国主义国家也改变了态度，纷纷“劝告”袁世凯停止帝制活动。

在内外交困的情况下，走投无路，袁世凯只能选择下令取消帝制，恢复共和，试图平息民愤。但即便是如此，他仍抱有一丝幻想，想继续当中华民国的大总统，并重用段祺瑞，企图借着段祺瑞来团结北洋军阀的势力，借此来镇压南方的起义力量，但是各个省的起义运动并没有就此而停止。六月，袁世凯忧惧病死，这便是帝制带来的后果。