虽然明神宗驱逐了了部分要求册立朱常洛为太子的大臣，但是京城依然有不少大臣拥护朱常洛。在长达十几年的斗争中，这种请求屡见不鲜。并在万历十八年达到顶峰。

万历十八年，群臣杜门请辞，逼迫明神宗册立太子。无奈之下，明神宗只好推至明年。之后有借各种理由推脱。

到了次年，工部张有德提议册立太子准备，不被明神宗批准，还被罚了三月俸禄。首辅申时行与大臣对此表示反对，明神宗大怒。后来又因为申时行在暗地里表明辩白，最终名誉扫地，辞官回家。一起请求的大臣，也被弹劾或梃杖。这是明神宗暂时赢得一局。

明神宗认为已经减少了阻碍，就开始着手改立太子，先将三位皇子都封王，然后再其中选太子。但是由于大学士王锡爵既不想得罪神宗，也不想与大臣为敌，就请求皇后抚养皇长子。这使大臣们纷纷质疑了太子的合法性。这一次明神宗也没有成功。

经过了长达15年的斗争，最后在皇太后的直接干预下，明神宗终于立了朱常洛为皇太子。

国本之争结果

明朝的国本之争，使得原本就日暮西山的大明王朝更加脆弱，它消耗了明朝最后的一丝希望。那么国本之争结果如何呢？

朱常洛画像

1601年，也就是万历29年，在争斗了十五年之后，明神宗终于向大臣们妥协，立朱常洛为皇太子。同时立朱常洵为福王，封朱常瀛为桂王、朱常浩为瑞王。明朝的一些成年的皇嗣也被纷纷册封。浩久的国本之争看似结束了，但是福王朱常洵并不甘心。原本他应该立刻去他的封地。但是朱常洵并未起身，他还在寻找机会。

万历四十三年，宫廷之中发生了著名的“梃击案”。一个叫张差的太监拿着木棍进入太子所居住的慈庆宫，打伤了守门的太监。张差被抓住后，供出是郑贵妃所指派，郑贵妃想谋害太子。此事一出，虽然不知道这件事情的真伪，但是整个朝廷的舆论，让郑贵妃和朱常洛压力巨大，大家都以为朱常洵有取代太子的野心。无奈之下，朱常洵只能离开京城，远走封地。

国本之争，皇太子朱常洛最终获得了胜利。再也没有人能够威胁他的地位。

国本之争，虽然是明朝的“祖训”获得胜利。但是这次“胜利”，却最终加速了明帝国的灭亡。太子朱常洛，也就是明光宗，他在政治上的无能，跟他的父亲有过之而无不及。明神宗和明光宗两父子，将明朝最后的一点生机断送了，二十几年以后，明朝在农民起义军的呐喊声中灭亡。