虽然罢黜百家独尊儒术有力，但是它弊端也占了绝大多数，所以后来人对于罢黜百家独尊儒术评价不是很高，认为影响主要表现在消极方面，也就是弊端上，毕竟罢黜百家独尊儒术是一个钳制思想的工具，不利于汉代思想文化的发展，更不利于中国传统文化的发展。