为了能够让佛教恢复到原来的声望，宗喀巴一直四处请教，吸收各个流派各位大师的长处，在此之后提出了改革的意见。宗喀巴的宗教改革可以从以下几个方面来说明，首先他认为修行的人必须严格遵守戒律，要求他们不能像其他普通人那样世俗，对于不能吃肉、不能淫乱的清规戒律应该一直施行下去，至于结婚生子等行为更是绝对不能做。

另外宗喀巴的宗教改革还包括避免原本世俗主对佛教的操控，应该和各个地方都建立良好的施主关系，将原本的经济依靠放到这些施主的身上，这样一来才能够摆脱政治方面的影响。除此之外他还规定了僧人的修习方式。在他看来修行是要按部就班一点一点的深入，先进行显宗的修炼，之后再来学习密宗的佛法，先进行思考之后再按照自己的思想进行修习。这样一来就能更好的铲除原本佛教的各种弊端。