首先，任何苍蝇不叮无缝的蛋，任何问题都必须先从内因开始寻找，镰仓幕府的灭亡也是同样的。源赖朝费尽了心血建立了镰仓幕府，但随后的几年时间里因赖源朝的逝世，镰仓幕府内部的政权几度发生夺权以及动乱的局面，虽然有北条政子出面主持大局，但源赖朝最终的结局仍然无法避免断后，之后镰仓幕府的实权实际掌控在北平家族手中。内部动乱导致镰仓幕府内部矛盾不断的扩大，致使“恶党”的出现。

其次，从外部原因来看，镰仓幕府成立后，中国元朝数度派兵攻打日本，其中大型的战役当属文永之役、弘安之役。虽然元朝的攻击猛烈，但日本幕府的一致对外却化解了两次危机，但是两次战役后，幕府内部的实力严重受挫已成为不争的事实。