小河公主的外貌特征主要有毛发为棕褐色，鼻梁比较高，眼睛十分深邃，这些表面的特征使考古学家一直认为小河公主是欧罗巴人种，根据DNA分析，可以看出早在四千多年以前，东方和西方的人群就在新疆发生了基因的混合，小河流域的人群是东西方的混合人群。

正是由于上述的研究发现，小河公主的外貌特征是由显性基因导致的，而小河公主内部的结构特征是隐性的基因导致的，小河公主亚洲谱系基因占大半是一个不争的事实。

不仅仅只是小河公主这一具干尸，对整个流域木乃伊的基因进行分析，发现大多数木乃伊都是有着东方谱系，都和小河公主一样亚洲谱系基因占大半，这些用来研究的基因都是从骨骼和牙齿当中提取出来的，具有很强的参考价值。这一谱系的起源地主要来自于贝加尔湖至中国北方这一片广大的区域。