但凡在朱祐简介中，都和另一个重要人物是分不开的，这个人就是东汉的第一位皇帝，光武帝刘秀。因为朱祐和刘秀、刘演兄弟自幼相识，而且还一起在长安念过书，在新朝农民军四起的年代，刘秀、刘演兄弟在舂陵起兵，朱祐便成为了刘演的护军。后刘演被更始帝杀害，朱祐孤身一人去向刘秀报信，并一直在刘秀军中效力。

　　朱祐的画像

　　更始元年，朱祐和刘秀一起征讨河北地区，他们先后击破盘踞在河北的王朗和数十支农民军，朱祐战功显赫。在扫平河北后，刘秀称帝，封朱祐为建义大将军。

　　同年七月，朱祐和刘植、坚镡、岑彭等人一起参与围攻洛阳的战役。这一场战役至关重要，对东汉势力定鼎中原起着决定性的意义，同时镇守洛阳的是参与杀害刘演的朱鲔。在朱祐等人的拼死力战之下，朱鲔投降。刘秀便定都在洛阳，朱祐被封为堵阳侯。

　　第二年，朱祐和王梁、贾复等人与五校农民军与檀乡农民军战于漳水，斩杀十余万人。之后又在羛阳之战中，迫降了五万五校军。

　　建武二年十一月，董訢、邓奉叛乱，朱祐奉刘秀之命前去平定，结果在和邓奉的交战中失败被俘。但邓奉没有杀朱祐，反而被朱祐劝降。

　　建武三年，汉军和黎王秦丰交战。汉军一路进展顺利，却在秦丰的都城黎丘城下久攻不下。刘秀十分愤怒，让朱祐在城破之后诛杀秦丰及其三族。朱祐经过两年时间的围城，终于迫使秦丰投降，但朱祐没有杀死秦丰，只将他押往洛阳听候处理。

　　建武九年，朱祐奉命讨伐依附匈奴的卢芳，但由于卢芳受到了匈奴的支援，因此朱祐被击退，他和王霸等人退兵常山郡的南行唐一带，组建防线，阻挡匈奴势力的南下。

　　建武十五年，朱祐主动刺去官职，赋闲在家，于十年后去世。