说到创建“皇寺庙”，还要从女真后金时期的蒙古察哈尔部落说起。蒙古察哈尔部落的林丹汗，出生于明代万历二十年(1592年)。当年，满、蒙各部落都有“立长为嗣”的观念和习俗。明代万历三十二年(1604年)，以长孙身份，林丹汗继承了祖父的汗位，成为统辖蒙古的“可汗”。林丹汗继位不久，便在蒙古漠南巴林部境内的阿巴噶哈喇山，修建了“瓦察尔图察汉浩特”(汉语“白城”)，作为政治、经济、军事中心。除了实力雄厚之外，林丹汗还是元世祖成吉思汗的嫡系子孙，并握有“传国玺”、“玛哈噶喇”金佛、《金经》三大法宝，足已号令蒙古各部落。

　　“传国玺”原先珍藏在元朝的内务府。元代顺帝被明代洪武帝朱元璋打败后，携带传国玺逃到沙漠，最终死在应昌府(内蒙克什克腾旗西北达里诺尔西)，传国玺不知去向。200多年之后，一个牧羊人发现了一件怪事：他的一只山羊一连3天不吃草，只是一个劲儿地在一个山岗下用蹄子刨地。牧羊人见状，将地面挖开，惊喜万分地得到了这方“传国玺”。牧羊人将“传国玺”交给了元代后裔博硕克图汗。后来，博硕克图被察哈尔侵占，“传国玺”便落到了林丹汗手中。

　　“玛哈噶喇”是藏语，意为“宝藏怙主”，译成汉语为“大黑天”，为藏传佛教中护法神之一。沈阳“皇寺庙”中的“玛哈噶喇”佛像，以黄金铸成，高约两尺，重1000两。据有关专家考证，南宋宝佑四年(1256年)，在甘肃凉州(武威)的忽必烈军营中，工匠巴勒布铸造了“玛哈噶喇”金佛。当时，这尊佛像被视为元朝皇帝的护法神、蒙古族的战神。“玛哈噶喇”金佛曾由五台山转至西藏。明代万历四十五年(1617年)，林丹汗下令，在“瓦察尔图察汉浩特”建造金顶白庙，供奉从西藏请来的“玛哈噶喇”金佛。