宣统三年（即1911年）5月18日，端方受到委任，作为川汉粤汉铁路的督办大臣。然后，因他欲同湖广总督瑞澄争功，而强行收四川当地的民办铁路为国有，这种行为激起了川湘鄂保路运动。同年，抵达了汉口。

同年，9月7日，成都血案发生，各种恐怖活动频频，四川局势在崩溃边缘。三日后，清政府免除了四川总督赵尔丰的职位，而委派端方前往治理。端方率领湖北新军第八镇之中的第十六协第三十一标以及三十二标一部，途径宜昌进入四川，到达资州。然而，情势大乱，11月27日，新军哗变，军官刘怡凤杀了端方与其弟端锦。清廷得到消息之后，赠端方了太子太保之位，谥号忠敏。

最终，民国元年（即1912年）1月10日晚7点整，端氏兄弟的头颅被置于装洋油的铁盒之中，重庆民军代表李某负责押解上船，运送至武昌。说来凄惨，之后，在鄂军都督黎元洪的命令之下，端氏兄弟的头颅被游街示众，当时武汉可谓是万人空巷，均前往围观此头。后端方长子端继先寻回了头颅，运回北京，给予安葬。端方之死已然落幕，都在历史之中漂流而去。